目前佛手瓜有20多个品种,尚未进行系统分类。
根据果实的颜色,可分为白色和绿色两种。
绿皮佛手瓜的植物长势强,分枝多,抗逆性强,果实圆锥形,绿色,果香,丰产,但品质较差,是目前的主要栽培品种;白皮型生长势较弱,藤蔓短而细,分枝能力弱,果实呈淡绿色、黄绿色、淡白色或奶油色等,表皮有光泽,肉瘤少,果肉组织致密,品质好,但产量不如绿皮型。
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