西双版纳自然保护区栖息着539种陆栖脊椎动物,鸟类429种,两栖动物47种,爬行动物68种,鱼类100种,分属18科54属。
其中亚洲象,兀鹫、白腹黑啄木鸟、金钱豹、印支虎属世界性保护动物。
野象、野牛、懒猴、白颊长臂猿、印支虎、犀鸟等13种列为国家一类保护动物,绿孔雀、穿山甲、小熊猫、金猫、菲氏叶猴等15种,列为国家二类保护动物,小灵猫、灰头鹦鹉、鹰等24种,列为国家三级保护动物。
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